Flaschengärung (méthode traditionelle) beschreibt die zweite Gärung in der verschlossenen Flasche und ist typisch für hochwertige Sekte. Durch lange Hefelagerung entstehen feine Perlage, mehr bis- und tertiäre Aromen sowie eine feine Textur; das erklärt, warum eine Cuvée 1888 von Schloss Wachenheim, die ausdrücklich Flaschengärung nennt, oft komplexer und lagerfähiger wirkt als im Tanksystem (Charmat). Flaschengärung verlangt zudem präzise Rüttel- und Degorgierprozesse, die die Qualität und Konstanz des Sekts direkt beeinflussen.