Kefirknollen sind lebendig und brauchen Pflege: kurzfristig im Kühlschrank in etwas frischer Milch lagern (bis zu 2–3 Wochen), für längere Pausen können sie getrocknet oder eingefroren werden. Ähnlich wie bei Wein, wo Füllstände (Ullage) und HF/IN-Füllstände relevant sind, ist bei Kefir Hygiene, Temperaturstabilität und regelmäßige ‚Fütterung‘ entscheidend für Qualitätserhalt. Bei längerer Lagerung empfiehlt es sich, die Knollen alle paar Wochen in frische Milch zu setzen, um Vitalität und mikrobielles Gleichgewicht zu erhalten.