Für Crémant du Jura kommen vor allem Chardonnay und Pinot Noir zum Einsatz; daneben sind regionale Sorten wie Savagnin, Poulsard und Trousseau zugelassen. Savagnin kann dem Crémant eine unverwechselbare würzig-nussige Note und zusätzliche Struktur verleihen, weshalb einige Erzeuger ihn in feinen Cuvées einsetzen. Bekannte Jura-Erzeuger wie Domaine Tissot oder Jean Macle arbeiten bewusst mit diesen Sorten, um unterschiedliche Stilrichtungen – von zitrusfrisch bis leicht würzig – abzubilden.