Optimal gelagert wird Lemberger in einem kühlen, dunklen Raum mit konstanter Temperatur von etwa 10–14 °C, 60–75 % Luftfeuchte und ohne direkte Licht- oder Vibrationsbelastung. Flaschen idealerweise liegend lagern, wenn noch ein Naturkorken verwendet wird. Für kurzzeitige Lagerung (1–5 Jahre) genügt ein kühler Keller; für längere Reifephasen empfiehlt sich eine professionelle Weinklimakammer.