Cognacflaschen lagert man idealerweise stehend, dunkel, bei konstanter Temperatur (ca. 12–15 °C) und moderater Luftfeuchte, frei von starken Gerüchen und Erschütterungen. Direkte Sonneneinstrahlung, große Temperaturschwankungen und hohe Luftfeuchte schaden Etikett und Kapsel; ein stabiler Weinkeller oder ein klimatisierter Lagerraum ist optimal. Nach dem Öffnen verändert sich das Bouquet langsam durch Luftkontakt, daher sind ungeöffnete Flaschen für Langzeitlagerung bevorzugt.